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[学位]

p35基因rs17852832 SNP多态性与阿尔茨海默病相关性研究

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Author:

史利利 (史利利.)

Abstract:

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是以进行性的近期记忆力减退、空间辨别力等认知障碍为主要临床表现的老年人常见的中枢神经系统退行性疾病。随着人口的老龄化其发病率迅速增长,AD已成为继心、脑血管疾病和癌症之后的又一严重危害人类健康的疾病。其病因尚不明确,也无确实有效地治疗方法,因此,对AD发病机制、预防和治疗的研究是目前凾待研究探索的重要课题。科学家们一致认为,AD是一种病因复杂的、由遗传学因素与环境等其它因素共同作用而引起的疾病。目前国内外已经明确定位的AD相关基因有:apoE基因、App基因、ps1基因和ps2基因,但这些疾病相关基因主要解释了脑组织内Aβ的异常增多和沉积,却不能解释神经原纤维缠结的形成及神经元的丢失的分子遗传学机制。因此,AD的遗传学危险因素还有待于深入研究。神经元特异性的CDK5调节亚基p35基因序列中存在多个SNP位点,而且某些位点的碱基变化可导致P35的氨基酸序列的改变。P35裂解成P25,大大增强了CDK5的活性,引发其对tau蛋白的异常磷酸化,促进了神经原纤维缠结的发生。并有研究证实在AD病人脑中P25/P35的比例明显增高,过量表达P25的转基因小鼠的研究也表明P25导致的CDK5活性的异常可引起大脑皮层及海马的神经元进行性丢失,前脑的萎缩及反应性的星形胶质细胞的增生,内源性的不溶性的Tau的聚集并存在多个位点的超磷酸化等类AD的病理改变。因此,P35的异常裂解与AD的病理改变密切相关。而p35基因多态性的因素是否参与了AD的发病机制,目前国内外尚无相关报道。目的:采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)分子生物学技术及限制性片段长度多态性分析方法,对AD患者及对照人群的p35基因rs17852832 SNP位点进行等位频率分析,用关联分析的方法,探索p35基因上该SNP位点与AD发病的相关性。方法:分别采取AD患者及非痴呆对照组老年人静脉血2ml,用快速盐析法提取基因组DNA,PCR法扩增出含rs17852832 SNP位点的p35基因编码区681-940片段,鉴定纯化后用MvaІ限制性内切酶进行酶切反应,酶切产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE),分析其酶切产物片段长度多态性与AD的相关性。结果: 1. 用快速盐析法从人静脉血中提取出人基因组DNA,1%的琼脂糖凝胶电泳检测所提基因组,可见条带整齐清楚,并测其OD值≥40ng/µl ,260/280≥1.5,二者最大分别可达1003.9ng/µl 和1.88。2. PCR产物经2%琼脂糖凝胶电泳检测发现,在250bp稍后方有一整齐清晰条带,为扩增出的目的条带,即长约260bp含rs17852832 SNP位点的p35基因编码区681-940片段。用凝胶纯化回收试剂盒将PCR产物纯化回收。3. 纯化后的含rs17852832 SNP位点的p35基因编码区681-940片段经限制性片段长度多态性分析后发现:对照组和AD组p35基因681-940片段均被限制性内切酶Mva І切成三个片段,大小分别约为114bp、90bp、53bp。rs17852832 SNP位点的等位基因均表现为C,基因型均表现为C/C,尚未发现等位基因A及基因型C/A或A/A的出现。4. 鉴定纯化后的p35基因681-940片段克隆入pMD18-T载体中进行测序,发现测序结果与GENBANK中的p35基因序列完全一致,表明克隆入T载体中的序列是p35基因编码区的681-940片段;另外,测序结果进一步表明p35基因编码区rs17852832 SNP位点的等位基因均表现为C,尚未发现另一等位基因A的出现;结合限制性片段多态性分析结果可推测出该SNP位点的基因型C/C,尚无C/A或A/A基因型的表现。结论:1. 成功运用快速盐析法提取出了人基因组DNA,并可达到较高的浓度和纯度。2. 成功利用TaqDNA聚合酶PCR技术扩增出了人p35基因中含rs17852832 SNP位点的681-940片段,并经测序鉴定后,证明其与GENBANK所提供的序列相符合。3 .利用限制性内切酶酶切技术和聚丙烯酰胺凝胶技术分析了p35基因中含rs17852832 SNP位点的681-940片段的长度多态性,并确定对照组和AD组p35基因rs17852832 SNP位点的碱基均表现为C,与GENBANK所提供的序列一致;所有样本在该位点的基因型均为C/C,尚未发现其另一等位基因A及C/A或A/A基因型的表现。

Keyword:

p35 阿尔茨海默病(AD) 单核苷酸多态性(SNP) 限制性片段长度多态性(RFLP)

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  • [ 1 ] 西安交通大学医学部

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Basic Info :

Degree: 医学硕士

Mentor: 钱亦华

Year: 2006

Language: Chinese

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30 Days PV: 5

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